Vykonává činnost speciálního stavebního úřadu pro vodní díla. Jedná se zejména o stavby kanalizací a souvisejících staveb, čistíren odpadních vod, odlučovačů tuků a ropných látek. Povoluje rovněž související nakládání s vodami u uvedených staveb. Vyhotovuje vyjádření, stanoviska, souhlasy a správní rozhodnutí vodoprávního úřadu ke stavbám a činnostem obecně i jako speciální stavební úřad pro vodní díla, zabývá se problematikou čištění komunálních odpadních vod z jednotlivých domácností i z provozoven, řeší havarijní stavy na povrchových a podzemních vodách.